El projecte s'estructura en tres plantes diferenciades. La planta baixa esdevindrà el nucli assistencial, on s'ubicarà el búnker per a l'accelerador de protons, a més de les consultes i les àrees d'espera adaptades per edats. Per la seua part, el soterrani acollirà els servicis tècnics i d'infraestructura, mentre que la primera planta es destinarà al personal especialitzat i a les instal·lacions de suport.

Una de les característiques principals del disseny és la integració amb l'hospital actual mitjançant un túnel subterrani que connectarà directament amb el servici d'Oncologia Radioteràpica. Esta connexió permetrà garantir la continuïtat assistencial i la coordinació entre els equips mèdics.

El centre també incorpora criteris de humanització, com ara un pati verd central pensat per al benestar emocional dels pacients. La inversió total en l'obra ascendix a 21,5 milions d'euros, finançats per la Generalitat, mentre que l'equipament tecnològic, valorat en 29,04 milions d'euros, ha sigut donat per la Fundació Amancio Ortega.

Segons les previsions, les obres i la instal·lació dels equips finalitzaran entre maig i juny de 2027. Després d'un període de dos mesos per a la calibració i comprovació dels sistemes, s'espera que el primer pacient puga rebre tractament a l'agost d'eixe mateix any.